MorphoSys wurde im Jahr 1992 als Morphosys Gesellschaft für Proteinoptimierung GmbH in Martinsried nahe München gegründet. Mitgründer waren der heutige Vorstandsvorsitzende Dr. Simon E. Moroney sowie das langjährige Aufsichtsratsmitglied Prof. Dr. Andreas Plückthun.
Die Anfangsjahre der Firma standen im Zeichen der Etablierung der firmeneigenen Technologien, die auf wissenschaftlichen Arbeiten von Prof. Dr. Plückthun am Max-Planck-Institut für Biochemie basieren. Ein erster kommerzieller Partner konnte im Jahr 1997 mit Pharmacia-Upjohn gewonnen werden. An den Finanzierungsrunden der Firma waren führende VC-Gesellschaften wie Atlas Venture, CDC Participation, International Biotechnology Trust, JAFCO, Korda Associates, Standard Life, Technostart, TVM und die 3i Gruppe beteiligt. Im Jahr 1999 ging MorphoSys als erstes biopharmazeutisches Unternehmen in Deutschland an die Börse und erzielte einen Emissionserlös von rund 25 Millionen Euro.
Heute ist MorphoSys eines der weltweit führenden Biotechnologieunternehmen im Bereich vollständig humaner Antikörper. Mit seiner einzigartigen HuCAL-Technologie entwickelt MorphoSys Antikörper, die sowohl für die Forschung und Diagnostik als auch für die Therapie von Krankheiten eingesetzt werden können. Im Bereich der therapeutischen Antikörper arbeitet MorphoSys mit namhaften Partnern aus der Pharma-Industrie zusammen. Im Bereich der Forschungsantikörper gehört MorphoSys zu den führenden Anbietern in Europa und zu den Top 20 weltweit. Das Unternehmen ist mit Niederlassungen in Deutschland, Großbritannien und den USA international präsent. MorphoSys ist im Prime Standard der Deutschen Börse in Frankfurt im Technologieindex TecDAX notiert.
| Jahr | Ereignisse |
| 1992 | Firmengründung in Martinsried / München |
| 1997 | Erste kommerzielle Partnerschaft mit Pharmacia-Upjohn Einzug in das Innovations- und Gründerzentrum Biotechnologie IZB, Martinsried |
| 1999 | Börsengang der MorphoSys AG Beginn einer umfangreichen Partnerschaft mit der Bayer AG Beginn eines Patentstreits mit Cambridge Antibody Technology |
| 2000 | Präsentation der HuCAL-Antikörperbibliothek Erstes HuCAL-Patent erteilt |
| 2001 | Präsentation der HuCAL GOLD-Antikörperbibliothek Beginn einer strategischen Partnerschaft mit der Schering AG |
| 2002 | MorphoSys erzielt Beilegung des CAT-Patentstreits Dr. Simon Moroney erhält Bundesverdienstkreuz am Bande |
| 2003 | Beginn einer Partnerschaft mit Pfizer HuCAL-Antikörper gegen Alzheimer mit positiven präklinische Ergebnissen |
2004
| Beginn einer strategischen Partnerschaft mit Novartis Präsentation der neuen Forschungsantikörpersparte Antibodies by Design Aufstieg in den Technologieindex TecDAX MorphoSys erreicht Gewinnzone |
| 2005 | Erster HuCAL-Antikörper kommt in die Klinik Übernahme der Biogenesis-Gruppe stärkt Forschungssegment Erste Partnerschaft mit japanischem Pharmakonzern |
| 2006 | Übernahme der Serotec-Gruppe stärkt Forschungssegment, Etablierung der Marke AbD Serotec HuCAL-Antikörper gegen Alzheimer (Gantenerumab) erreicht die Klinik |
| 2007 | MorphoSys gibt umfassendes Entwicklungsprogramm für neue Antikörper-Technologieplattform bekannt MorphoSys und Novartis bilden eine der größten Forschungskooperationen der Pharma- und Biotechnologiebranche zum Aufbau einer innovativen therapeutischen Antikörperpipeline |
| 2008 | Erster firmeneigener Antikörper MOR103 kommt in die klinische Entwicklung MorphoSys präsentiert neue Antikörperbibliothek HuCAL PLATINUM Erster HuCAL-Antikörper in einer klinischen Phase-2-Studie |
| 2009 | MorphoSys feiert 10-jähriges Börsen-Jubiläum |
| 2010 | Erster firmeneigener Antikörper MOR103 wird im Patienten erprobt |